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熒光濾波片選取的原則是在成像端盡可能讓熒光/發射光透過，同時完全阻擋激發光，獲得最高的信噪比。尤其是對于多光子激發和全內反射顯微鏡的應用，微弱的噪聲也會對成像效果造成很大的干擾，因此對信噪比的要求更高。
通常我們看濾光片的參數一般會看透射率光譜，但往往熒光相對于激發光的強度很弱，選擇濾光片更需要參考阻擋深度光譜圖——OD值。OD值更能直觀地反映濾光片對光的阻擋特性。
在選擇激發濾光片和發射濾光片時，兩者的阻擋深度光譜交點（OD交點）是重要的判斷標準，一般要求寬場光源激發是交點OD值大于5，激光激發時大于OD6，以實現較好的熒光信噪比。
